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基于图压缩的序列到图比对方法、系统、装置、存储介质

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专利号 2024113125193 专利名称 基于图压缩的序列到图比对方法、系统、装置、存储介质
专利类型 发明专利 国际分类 G16B 20/30 (2019.01)
申请人 烟台大学 申请地址 山东省烟台市莱山区清泉路30号
发明人 权威,邓炎斐,康金军,刘壮,朱晓 申请日期 2024-09-20
下证状态 已下证 更新时间 2026-08-20 09:37:59
专利摘要 本发明涉及基因测序领域,具体为一种基于图压缩的序列到图比对方法、系统、装置、存储介质,获取基因组图和测序序列,将基因组图中的可合并结点进行合并,生成合并结点,对基因组图进行更新后得到压缩图,基于四位二进制标记位对压缩图和测序序列进行碱基编码,引入碱基置换罚分后进行序列到图的比对,得到不同罚分模式下的比对分数,同时基于最佳比对分数位置确定回溯起点,基于回溯起点依次在其相邻位置中选择其比对分数来源方向作为回溯方向进行回溯,得到最佳比对路径,减少了图数据规模,提高了比对效率。

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身份证
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